אין לאחסן את המפחית הפלנטרי בחוץ או בסביבה לחה.
הנח לוח עץ או חומר מתאים אחר בין המפחית הפלנטרי לאדמה; אסור שהמפחית יבוא במגע ישיר עם הרצפה.
עבור מפחיתים המאוחסנים במשך יותר מ-60 יום, כל המשטחים המעובדים-כגון אוגנים, פירים ומצמדים- חייבים להיות מצופים בחומר מונע חלודה-.
אם יש לאחסן את המפחית הפלנטרי במשך יותר משישה חודשים, יש לבצע את הליכי הבדיקה והתחזוקה המיוחדים הבאים:
כל הרכיבים המעובדים צריכים להיות מצופים בשומן כדי למנוע חלודה. מקם את המפחית כך שפקק האוורור יהיה בחלק העליון, ומלא את היחידה בשמן סיכה (שימו לב: שמן זה אינו מתאים לפעולה ארוכת טווח-). לפני הפעלת המפחית, רוקן שמן זה ומלא מחדש את היחידה בכמות המתאימה של חומר סיכה טרי.
אחסון נכון חיוני לשימור הביצועים המקוריים וחיי השירות של המפחית הפלנטרי. לעומת זאת, אחסון לא תקין יפגע בביצועיו ויקצר משמעותית את אורך החיים התפעולי שלו.